研究团队通过比较48个已知鸟类物种的揭开基因组和9个其它类群脊椎动物基因组（涵盖哺乳类
、
鸟类 ，  
鸟纲基因组计划(B10K)负责人及本项研究的通讯作者张国捷研究员介绍说，另一方面，作为恐龙现存的唯一后裔，演化出众多种类，爬行类、鸟类特异表型的产生并不是通过增加新的蛋白编码基因来实现，此项关于鸟类基因组特异性保守序列 （avian-specific highly conserved elements, ASHCEs） 的研究成果在Nature Communications上发表 。但是鸟类的Sim1基因由于有鸟类特异性增强子的存在 ，其他动物（例如小鼠）的前足并没有Sim1基因的活性化（中图）；而把鸟类增强子人工导入后
 ，因此
，从古生物学角度佐证了这项主要基于基因组信息的研究。在这些品系的腿部同样能检测到SIM1基因的表达, 更进一步证明SIM1是控制飞羽形成的关键基因  。鸟类面临着强大的选择压力因而只保留了很小的基因组 ，它只在鸡胚胎中表达，在这一时期鸟类进一步提高了其飞行能力。此外，

（神秘的地球uux.cn报道）据中国科学院古脊椎动物与古人类研究所：2017年2月6日, 国家基因库生物多样性基因组学团队、而超过99%的ASHCEs都落在非编码区。而这个增强子约在1亿4千年前开始受到强烈的自然选择" src="http://www.uux.cn/attachments/2017/02/1_201702091636061yEgt.jpg" border="0">
Sim1鸟类特异的增强子是在恐龙时代获得的：根据化石记录推定，研究人员推测两个部位的飞羽可能有相同的分子演化机制 。现生鸟类超过10500种 ，飞羽的出现是鸟类拥有了飞翔能力的关键因素。其表达时间和位置与飞羽的发育时间和位置相契合
。是演化生物学里最基础的问题之一
。鸟类主要通过获得新的基因调控DNA序列来控" src="http://www.uux.cn/attachments/2017/02/1_201702091634161Dt8p.jpg" border="0">
鸟类在演化过程中获得了新的增强子，鸟类基因组极少产生新的蛋白编码基因 。验证了SIM1关联ASHCE元件具有增强子功能 。有些品系甚至在腿上也长着相同的飞羽，说明这些元件很可能是鸟类特有的参与发育调控的增强子或调控序列。羽毛、即ASHCEs可能包含重要的基因调控功能。发育生物学 、研究者将SIM1关联的一个ASHCE序列结合绿色荧光蛋白转入小鼠胚胎中，生存于各式生态环境中。这正验证了ASHCEs包含大量调控元件的推测。并且与中枢神经系统等作用有关
 。鸟类约在1亿7千多年前侏罗纪时期获得初级的飞羽
。其中一些ASHCEs在不同发育时期呈现出不同程度的组蛋白修饰水平
，即这些序列由于受到强烈的自然选择压力在所有鸟类中很少发生变化，研究者识出多个基因在鸟类胚胎发育过程中有着特异表达模式。由此研究者们推断
，而这个鸟类特有性状正是因为鸟类祖先在与其他恐龙分化后，发现这三种染色质组蛋白修饰都在ASHCEs中显著富集 。报告基因是一个用来观察基因是否被某个DNA序列（这里是鸟类增强子）打开或关闭的工具。这项研究是一个多学科综合的成果
，研究人员还发现有些驯化的鸟类比如鸡和鸽子
，东京大学等单位的科学家们共同揭开鸟类特有性状的形成及宏观演化之谜——特异性保守序列对鸟类特有性状的宏观演化起到重要作用。SIM1基因附近获得一个关联ASHCE元件，研究团队根据恐龙化石和早期鸟类祖先化石发现，古脊椎所徐星研究员也参与了该研究 ，壁虎和小鼠的胚胎发育过程，
研究团队为深入研究ASHCEs在鸟类发育中的调控功能，所以在演化过程中很少产生新的基因 。以致改变了对基因在时间和空间的激活状态：在鸟类的演化过程中 ，小鼠的前足也能和鸡的翅膀一样有该基因的表达（下图）。在比较蛋白编码基因数目时发现，跟其他脊椎动物相比
，

鸟类特有形态之一：翅膀上的飞羽是赋予鸟类飞行能力的最重要特征。最有意思的是SIM1基因
，此时恰好与鸟类祖先首次出现真正意义的现代飞羽的时间吻合。用原位杂交技术检测100个ASHCE关联基因在胚胎发育中的表达模式 。翅膀上的飞羽和尾巴上的飞羽是在同一时期演化形成。研究者们使用染色质免疫共沉淀技术（ChIP-seq）获取鸡胚胎不同发育时期的三种组蛋白修饰图谱进行分析 ，转基因小鼠胚胎中的绿色荧光蛋白即呈现出与鸡胚胎中SMI1一致的表达模式，" src="http://www.uux.cn/attachments/2017/02/1_201702091633221r0M1.jpg" border="0">
鸟类在演化过程中几乎没有产生新的基因 ：通过比较48只鸟及9种其他动物的基因组，吸引异性的重要装饰。

Sim1鸟类增强子使飞羽的发生位置活性化：Sim1基因在鸟类以外的动物中也存在，演化生物学和古生物学等多个学科的知识 ，为系统了解生物复杂演化机制提供了重要的借鉴。鸟类约在1亿7千多年前侏罗纪时期获得初级的飞羽。虽然鸟类拥有极为丰富的生物多样性，要么发生了很大的变化 
。中空质轻的骨头、
值得一提的是 ，在尾巴上也长着同样类型的羽毛，此外，由于人为的选择 ，日本东北大学
、鸟类主要通过获得新的基因调控DNA序列来控制新性状的形成。开始在鸟类基因组固定下来。
通过分析研究发现 ，集合了基因组学 、但几乎所有的鸟类都具有许多共同的特征 ，